教育部向廣東省政府發出通知，正式同意建立南方科技大學。自2007年籌備以來，一場謀求踐行自主辦學理念的社會要求與國家教育權力把持的教學體制之間的，表象化的對抗到此為止。

　　而該校校長朱清時此前一再強調的建校“時機”，執意推行的“邊開車、邊鋪軌”式的辦學方法似乎在這一刻得到了某種程度的“應驗”。

　　南科大將由廣東省領導和管理，相應的，教育部要求廣東省和深圳市進一步加大資金投入力度，加快學校新校區的建設速度，力爭在未來3至4年內完成學校二期工程的建設任務，促成學校硬體條件基本形成。

　　不過，硬體條件從來都不是最主要的問題。事實上，通過過去幾年的努力，相關的基礎設施建設已經基本到位，至少足以承擔辦校最初幾年，預計規模的學生學習、生活。然而，南科大的發展走勢卻沒有它“創辦世界一流研究型大學”的口號那樣明朗。

　　如果説之前遲遲未獲教育部批准的時候，出於無奈，窮盡各種可能的堅持、另辟蹊徑顯示出了南科大一切自主的可能，那麼獲教育部認可的建校，會不會意味著自主辦學的教育理想已經向現實妥協。退一步説，即使這只是外界的一種臆斷，曾任10年中科大校長的朱清時，在辦學過程動用的中科大人脈乃至經驗，會不會讓南科大最後拐回中國高等教育體制的“規律”，不可避免地甚至不知不覺地因循慣常教育準則，依然是個問題。

　　更迫切的問題是，面對近在眼前的正式招生，這個被視作教育改革試驗田的學校，有沒有確定好一條屬於它的試驗之路。

　　後一個問題起初並沒有進入公眾視野。直到去年，爆出南科大籌建團隊核心成員，幾名香港科技大學教授由於辦學理念上的分歧相繼退出，停留于合法建校之膠著的目光才轉到這個更為核心的問題上。彼時幾位教授指出，從初步的學科規劃和學科框架，到以此為基礎的教授招聘，從管理團隊到內部管理規章制度與問責機制以及外部監管問責法規，從學校定位到發展路徑，南科大存在著大大小小沒有理清的問題，還不具備招生條件，但建議未被採納。

　　時隔近一年，很難説離職教授提出的問題全數解決了。具體到當時暴露的，諸如除兩名教師外其餘全是兼職，時刻處於變動的師資名單，實驗室數量和標準等情況有沒有得到改善，外界還不得而知。而從雙方的分歧來看，細部的問題皆是辦學思路相左的延伸，即類似于先有學術團隊還是學科框架發展規劃、先有學科規劃還是配套實驗室等相互牽連的“雞生蛋、蛋生雞”的問題始終糾纏其中。在港科大團隊出走後，它們仍然是一個與學校追求的辦學質量息息相關的、需要審慎對待的問題。至於南科大有沒有找到一條辦學與改進相同步的折中道路，同樣不得而知。

　　南科大一度以港科大為模倣對象，邀請港科大教授開展與港科大的合作都是例證。不同的是，港科大建校伊始的一切準備就緒就決定了它現代研究型大學願望的達成。而隨著港科大教授的退出，雖然港科大仍然是追趕的目標，但朱清時更強調的是必須承認的國情現實、模式的不可複製。事實上，持續幾年的建校拉鋸只是象徵意義的體制衝突，在未來的辦學過程中，等待著南科大的是更多不那麼“顯見”的體制障礙與衝突。

　　允許一個“脫軌”的大學運轉，無論如何都是個拭目以待的嘗試，但這並不是歡呼時刻的到來，真正驚心動魄的試驗才小心翼翼地踏出第一步。