6月15日，山西運城楊家卓村，鄉親們在景海鵬老家的院子裏豎立起用千余個饅頭組成的“神舟九號”飛船及長征火箭模型，預祝他二次“飛天”成功。

劉旺的父親劉紹平(前左二)、母親劉翠蓮(前左三)觀看直播

　　第一，由無人參與到有人參與。

　　第二，組合體飛行方案不同。神八不載人，神九與天宮一號將載3名航天員，進行組合體停靠3人10天的最長飛行任務驗證。神九獨立飛行時間與神八相同，正常情況下獨立飛行3天，在應急情況下可以獨立飛行5天；神九組合體停靠時間由神八的14天變為10天，目的是驗證組合體最長飛行支持能力(3人10天)。

　　第三，交會對接進入方向不同。神八兩次對接全部採用從後向進入對接，也就是説飛船在後，向前追趕天宮一號。神九將進行前向對接，也就是説，飛船在前，由天宮一號追趕神九進行對接。

　　第四，交會對接方法不同。神八採用的是在飛船上的交會對接設備的引導下自動交會對接，在此基礎上，神九還將採用人工手動控制方法進行。

　　第五，交會對接環境不同。神八採用的是在陽照區開始自動交會對接，待對接完成的時候，已經處在陰影區，而神九載人交會對接則在全陽照區間進行。太空各種光波對交會對接測量設備會造成干擾。

　　第六，由自成一體到聯成一體。神八與天宮一號交會對接只是完成了兩個飛行器的剛性連接，連接兩個航天器的艙門並沒有打開。而神九的航天員要進入天宮一號目標飛行器裏，進行工作、生活和組合體載人環境的全面驗證，因此將聯成一體。

　　第七，飛船內搭載設備不同。神九返回艙配備了乘坐3人的座椅。

　　第八，緊急故障情況下處置預案不同。神九增加了手控交會對接故障模式與對策、手動控制禁止指令無法正常發出等故障預案等，進一步確保航天員安全。

　　第九，控制方案進行了局部改進和優化。神九系統在總結神舟八號交會對接經驗的同時，針對神九的任務，對自動交會對接與撤離、人工手動控制交會對接與撤離、返回控制等進行了局部改進和優化，並進行了大量的試驗驗證。

　　第十，返回方案變化。神九返回的控制方案中，對打開回收主開關關鍵指令相應增加了手動控制指令作為備份，返回的可靠性和安全性大為提高。