釣魚島爭端升級導致日中關係持續緊張，也讓日本經濟受到直接拖累。摩根大通的報告分析稱，日本經濟在2012年最後兩個季度將連續負增長，日本汽車業成為重災區。日本媒體擔心，日中摩擦呈長期化趨勢，不少日本民眾希望首相野田早日下臺。

　　受釣魚島爭端影響，日本經濟被深深拖累。美國《商業週刊》7日援引摩根大通的報告稱，中日兩大經濟體貿易總額高達3400億美元，中日領土爭端激化導致日本出口下降、前往日本的中國遊客減少。摩根大通日本公司經濟學家菅野雅明和安達正道預計，日本第四季度GDP將負增長0.8%，而非原先預計的零增長。摩根大通、摩根斯坦利和巴黎銀行均預言，今年8月份日本出口較去年同期萎縮5.8%，為連續第三個月負增長，對中國的出口則下降9.9%，對歐盟更下降22.9%。日本經濟在2012年最後兩個季度將連續負增長。摩根大通經濟學家表示，中國經濟也可能因此受到不利影響，因為日本企業可能因此加速將其在中國投資、産能向亞洲其他國家轉移。

　　日本汽車業成為重災區。美國全國廣播公司“財經頻道”8日稱，由於中國消費者在反日示威後對日本品牌避之唯恐不及，剛剛過去的第三季度，日本汽車整車對華出口估計下跌70%，而汽車零部件出口可能下跌40%。馬自達日前表示，上個月在中國的銷售業績下降了35%，三菱汽車9月份在華銷售業績較去年同期下跌63%，而豐田8月份在華汽車交貨量下降50%。法新社8日還稱，由於中日關係持續緊張，日本日産、本田、豐田三大汽車品牌都計劃在中國黃金周假期結束後削減在華一半産能，日産將暫停夜班，豐田和本田則將減少每天生産線運營時間，並放慢生産線流程速度，如果減産持續一個月，三大品牌將分別減産3萬-4萬輛汽車。

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　　日本《東京新聞》8日稱，旅遊業所受打擊更加致命，因為近年來日本旅遊業的增長一直拜中國遊客增加所賜。中國遊客人數激減，日本旅遊景區發出了“悲鳴”。英國《金融時報》稱，今年4-6月，每名中國遊客平均在日本消費2250美元，2011年3月日本地震和福島核泄漏事故導致旅遊業受重創，正是中國遊客的增加讓日本旅遊業很快恢複元氣，今年7月中國遊客訪日數量首次突破20萬大關。但日本將釣魚島“國有化”後，6周內中國至沖繩旅遊訂單取消4300份，且新訂單寥寥無幾。

　　美國《華爾街日報》7日引述日本高級投資官員菅原鎮雄的話稱，此前無人預料到中日釣魚島糾紛會影響經濟至如此地步，“以往政治問題歸政治問題，政冷經熱是正常現象”，如今人們發現，越來越無法忽視政治危機對經濟的影響。《日本經濟新聞》擔心，圍繞釣魚島問題出現的日中緊張，是減速中的世界經濟的巨大風險。世界第二和第三經濟大國之間的冷卻如果長期持續，可能導致繼美國次貸危機、歐債危機之後的又一次世界經濟危機。日本和中國擁有共同的責任，那就是超越偏狹的國家主義，防止惡性循環發生。

　　此外，日本《産經新聞》8日援引日本第11管區那霸海上保安總部的消息稱，7日在釣魚島海域執行巡航任務的5艘中國公務船相繼駛離該海域後，8日上午，又有4艘中國海監船進入釣魚島水域進行巡航。日本海上保安廳巡邏船向中方船隻發出“警告”，中國海監船再次反駁日方：“釣魚島及其周邊附屬島嶼是中國的固有領土，我方正在進行正常巡航。”報道稱，這是中國公務船連續第8天在釣魚島附近海域巡航。

　　曾擔任日本NHK電視臺歐洲總局局長的記者大貫康雄撰文稱，領土問題如果任由感情宣泄，將導致難以預想的結果。大貫稱，日本必須對此有所覺悟，不是單憑增強軍備就可以解決的。要想改善日中關係的現狀，就應該儘快更換首相。日本民眾也希望野田早日下臺。日本TBS電視臺公佈了6日和7日的輿論調查結果，認為應該改善日中關係的人佔40%，認為應該對中國強硬的佔32%，認為安倍晉三適合擔任日本首相的人佔40%，認為野田適合擔任首相的只有29%。