一般認為，醫藥電子商務是指藥品生産者、經營者或使用者，通過信息網絡系統以電子數據信息交換的方式進行並完成各種商務活動和相關的服務活動。美國是藥品電子商務開展較早的國家，經過十多年的發展，不斷深入和完善，已經形成了B2B、B2C、第三方醫藥電子商務交易平臺（公共交易平臺）等多種形式並存的局面，並且通過發達的第三方物流網絡完成藥品的分銷與配送。在歐洲，歐洲藥劑師協會下屬的藥店90%以上都開展網上藥品預訂服務，網上醫藥交易十分普遍。

　　與國外醫藥電子商務發達的國家比較，我國醫藥電子商務顯得起步較晚、發展滯後、進程緩慢。在電子商務總體發展良好的態勢下，醫藥電子商務的發展情況卻不容樂觀。截止到2010年3月為止，經審核批准，可以提供互聯網藥品交易服務的網站有43家，其中，針對個人消費者的網上藥店有20家。網上銷售佔醫藥流通領域的市場份額幾乎可以忽略不計。

　　醫藥電子商務是以電子平臺運營商為橋梁，建立醫藥生産企業——物流公司——醫院(藥房、藥庫)——銀行直接聯絡的模式，能夠實現藥品的信息流、物流、資金流的“三流”完全統一。隨著現代信息網絡技術的迅猛發展，藥品交易行為從單一的櫃臺式銷售向櫃臺與電子商務網絡平臺相結合的形式發展是必然的主流趨勢。

　　目前，國內基於B2C的醫藥電子商務主要有兩種平臺模式：自建自採平臺模式和第三方電子商務平臺模式。與其他行業電子商務的蓬勃發展相比，醫藥電子商務因交易物品的特殊性，其發展顯得更為艱難。主要表現在：總體上電子商務應用分散，發展水平不高，從業公司規模偏小；從應用深度上，主要還是停留在信息服務層面，少有完整的電子商務服務；從商業模式上，網上藥店發展受限制，以網上批發業務為主的B2B模式成為電子商務應用的主流。

　　在宏觀層面，醫藥電子商務的準入門檻高；相關政策法規尚不健全；無法與醫保對接；監管仍存在漏洞，市場仍不規範；醫藥物流體系不完善。

　　在中觀層面，醫藥電子商務的運營、維護投入高，盈利週期長；醫藥電子商務企業面臨的成本壓力高；網上銷售藥品的結構尚不合理；醫藥電子商務企業的諮詢服務不完備。

　　在微觀層面，醫藥電子商務也存在消費者對醫藥電子商務的認同問題；消費者的觀念意識問題和部分醫藥企業社會責任缺失，非法醫療廣告充斥著互聯網等問題。