2006年，為確保農村義務教育經費保障機制改革順利實施，推動農村義務教育持續健康發展，根據新修訂的《義務教育法》和《國務院關於深化農村義務教育經費保障機制改革的通知》（國發〔2005〕43號）要求，教育部、財政部聯合下發了關於加強農村義務教育經費保障機制改革督導工作的意見。2007年，教育部又下發了關於進一步做好農村義務教育經費保障機制改革有關工作的通知，通知中對進一步嚴格規範農村義務教育階段學校收費行為、進一步細化農村中小學預算工作、確保“一補”政策（即補助寄宿生生活費政策）落實到位、積極做好“普九”債務清理化解工作等方面提出了更加明確和具體的要求。

　　農村義務教育階段經費保障機制的設立和實施，使得農村義務教育階段的經費得到了保障，農村義務教育的實施有了經濟基礎，讓農村孩子能上得起學、上好學也開始成為現實。近年來，國家相繼實施了“中小學危房改造工程”、“農村中小學寄宿制學校建設工程”、“農村中小學薄弱學校改造工程”等一系列重大工程，滿足了200萬新增學生的就學需求和197萬新增寄宿生的住校需求。同時，國家逐年提高義務教育階段學生生均公用經費，目前標準是小學生每年400元，初中生每年600元，一些地方還在此基礎上有所提高。針對農村師資的薄弱環節，國家通過“特崗”教師計劃、城鎮教師支教、城鄉教師交流等措施，為農村學校輸送優質教師資源，並在國家組織實施的一系列教師培訓重大項目中，對農村教師培訓予以重點扶持。同時，通過實施遠程教育，實現優質教育資源共享，覆蓋1億多農村中小學生。

　　針對農村學生營養不良的問題，從2011年秋季學期起，中央財政每年安排160多億元專項資金，為680個國家試點縣的所有2600萬名農村義務教育學生提供每天3元的營養膳食補助。