埃及安全部隊和司法人員29日在開羅突然搜查了17家外國人權等機構，其中包括總部設在美國的3個團體以及德國的“阿登納基金會”。此舉引發以美國為首的西方國家強烈不滿。批評者稱，“出人意料”的突查行動違背埃及政府建立民主政體的初衷。但埃及軍方則強調，行動是出於維護埃及內政安全考慮而進行的，“揭露外國勢力如何挑動本國持續騷亂是調查行動的一部分”。

　　據中東媒體報道，29日傍晚，全副武裝的埃及士兵及警察突然出現在開羅的17家外國非政府組織機構辦公室，“他們審問了辦公人員，查封、沒收了辦公電腦，並帶走了文件、手機和現金等”。警方當晚至少查封了5個辦公室。

　　埃及官方媒體援引埃及檢察官辦公室的聲明稱：“此次突擊搜查是正當行為，有證據表明這些組織違反了埃及法律法規，其中包括缺少許可證等。”埃及中東通訊社發文稱，這一行動是對非政府組織非法收受外國資助而進行的“廣泛且持續”的調查之一，“埃及軍方認為有些人權組織在私下進行外國式宣傳，支持抗議者”。

　　美國國務院發言人紐蘭對突查表達“深深擔憂”，要求埃及軍方立刻停止“騷擾”行為。紐蘭還稱，美國駐埃大使已與埃及總理取得聯絡，國務院高官也已召見埃及駐美大使，“如果事件持續的話，美國將重新考慮對埃及的13億美元軍事援助”。

　　德國外交部長30日也表示，德國已經就開羅警方突襲人權機構一事召見埃及駐柏林大使。

　　自從反政府示威爆發後，埃及政府一直指責外國勢力通過非法資助在埃及活動的非政府組織來煽動示威者。埃及司法部的聲明表示，目前僅僅在首都開羅就有大約300家非政府組織正在接受未經授權的外國資助，軍方和政府多次警告外部勢力不要干預埃及國內事務，但成效並不明顯。因此埃及國際合作部&&從今年7月起開始對涉嫌國外非法資助的案件進行調查。據報道，埃及政府在啟動這一調查前，美國駐埃及大使安妮帕特森就曾公開宣稱，自埃及前總統穆巴拉克下臺以來，美國已經向該國的非政府組織提供了大約4000萬美元的資助。

　　埃及《金字塔報》30日稱，這些資助主要用於支持埃及的所謂民主和自由進程，並推行西方價值觀和意識形態。“但事實上，它們都是美國國會提供的資金以監督海外選舉和促進外國‘民主’的工具”。報道稱，被查封的3家美國機構其實正在負責培訓埃及國內新建政黨工作人員，包括教他們如何參與並贏得選舉等。

　　然而受到查封的人權機構則反駁稱，他們的工作重點是促進民主進程，沒有給候選人及其他團體提供資金或物質援助。美國《洛杉磯時報》稱，埃及軍方想利用打擊“外國干預”的幌子撥旺民族主義的火焰，轉移民眾視線借此逃避虐待抗議者的指責。

　　據法新社報道，埃及25個國際與國內組織聯合發表聲明稱：“埃及軍方‘不道德的侵犯’即便在穆巴拉克時期也未曾有過，軍方是想借此掩蓋過渡時期的治國無能以及無法滿足改革的需求。”甚至有人權組織的領導人指責軍方缺乏建設真正民主的誠意，“他們在為自己的錯誤找替罪羊”。