今年以來，由於成本升高和政策性降價，醫藥行業的基本面承壓，市場對行業盈利能力存疑，加上2010年下半開始的上漲推高板塊估值，醫藥板塊走勢相對低迷。10月至今，醫藥板塊整體表現略遜於大盤。不過業內人士認為，無論是基本面或是估值，目前醫藥板塊都面臨著轉機，隨著行業運行趨勢逐步回歸常態，醫藥板塊有望走出低谷。

　　從基本面看，壓制板塊表現的最主要原因在於企業利潤率水平下降。數據顯示，今年前8個月，醫藥製造業實現營業收入總額8909億元，同比增長30.67%，增速同比上漲4.98個百分點；實現凈利潤總額866億元，同比增長20.43%，增速同比下降14.28個百分點。民族證券表示，總體來看，醫藥行業收入穩步增長，表明需求呈現旺盛格局，但利潤增速遠不及收入增速，説明原材料成本、人力成本的上升以及部分産品的價格下降，確實對行業的盈利産生了較大壓制。

　　不過，從近期公佈的醫藥企業三季報來看，主導企業盈利預期基本到位。例如天士力三季報顯示，報告期內主營收入同比增長41%，業績同比增長62%；康緣藥業、雙鷺藥業、東阿阿膠等公司的三季報，也顯示出這些公司在三季度經營度過低谷，出現恢復性上升。

　　而從政策面看，近期也有一些利好消息傳出。如國務院總理溫家寶10月26日主持召開國務院常務會議，討論通過了《疫苗供應體系建設規劃》。興業證券認為，《規劃》進一步明確了國家將繼續加大在疫苗領域的投入，疫苗品質過硬、配送體系完善的大型疫苗企業，將進一步強化在行業中的話語權，而致力於研發生産計劃免疫疫苗、重大疾病疫苗的企業，將有望獲得政府更多的資金支持和政策傾斜。此外，媒體報道稱，中藥産業“十二五”規劃和醫藥包裝“十二五”規劃有望隨生物醫藥産業“十二五”規劃一起出臺，在中藥産業“十二五”規劃初稿中，備受矚目的中藥材儲備制度已有明確制度規劃；而醫藥包裝“十二五”規劃中，包裝材料相容性將是監管部門2012年重點開展的工作內容。同時，還有消息稱，我國《藥用原輔材料備案管理規定》和《基本藥物目錄》也有望陸續出臺。相關政策的出臺無疑將對行業發展起到良好的推動作用。

　　更關鍵的是，目前行業的估值正在逐步向合理區間回歸。業內人士表示，短期板塊指數承壓主要在於相對溢價較高。國聯證券數據顯示，截至10月23日，醫藥生物整體市盈率相對全部A股的溢價比例為2.24倍，仍處於較高位置。

　　不過，東方證券表示，未來12個月的企業贏利能力為滾動市盈率的計算基礎，目前醫藥板塊的整體市盈率已經低於2006年以來的平均水平，為20倍，並創出年內新低，同時接近2008年金融危機時的歷史最低點。東方證券進一步指出，由於醫藥板塊基本為中小市值股票，以中證700作為參考，板塊相對於中證700指數的溢價率為16%，與歷史平均水平持平，考慮到醫藥行業未來十年成長性特點在所有板塊中比較確定，目前的估值水平已經明顯低估。中金公司也表示，目前的估值情況下對板塊不必過於悲觀，建議把握結構性機會，在估值安全邊際基礎上尋求絕對投資收益。