這部分檔案共有6件，包括3件報告、2件《郵政檢閱週報》、1份《大阪每日新聞》，記錄了南京大屠殺後1-2個月內南京、上海及周邊地區治安恢復狀況和日軍屠殺、強姦的暴行，與之前的國內外史料研究成果相互印證。

共25件，檔案記載了南京、下關、句容、鎮江、金壇、常州、丹陽、蕪湖、寧國9個市縣日軍兵員數及“慰安婦”配置比例，日軍在10日內利用“慰安所”的人數統計等內容，以及日軍強徵、蹂躪、奴役“慰安婦”的惡行。

"特別移送"內容檔案近200件，記載與"特別移送"有關的共計277人，大部分為中國人，還有朝鮮人、俄國人。檔案館工作人員發現各地憲兵隊上報的審訊材料的右上角，都蓋有關東軍司令部"軍司二課"和"特別移送"字樣的印章。

共計14件，均屬於第一首史料，包括12份報告、1份《通信檢閱月報》、1份管理制度。真實記錄了日軍對以中國戰俘為主的"特種工人"的嚴格管理、殘酷迫害和勞工嚴酷惡劣的生存狀態，以及勞工逃跑、反抗的各種情況，具有較高的史政價值。

此次發掘的檔案中，涉及"違禁"內容的有23件，包括22件郵檢月報、旬報，1件《軍事警察要報》，其中15件是日本人之間的信件，出自日軍之手，是日軍殘暴罪行的真實反映。

此次公佈的這批檔案有10件，主要記載了日本"開拓團"奪佔東北農民土地、欺壓東北農民以及日本移民規模等方面內容，反映了日本對中國東北移民侵略的實質。

反映這部分內容的檔案共有4件，記錄了抗日名將楊靖宇、魏拯民、陳翰章、趙尚志等抗日英雄遭到日軍殺害犧牲的情況；記錄了日軍在東北境內出動軍警對抗聯將士進行鎮壓、圍剿，以及抗日部隊動向等情況。

這部分檔案是吉林省檔案館從關東憲兵隊檔案中新近發掘整理出來的，一共有3件。主要包括1944年日軍擊落美軍B29轟炸機部分戰俘的名單、審訊記錄以及英美戰俘被管理、虐待的情況。