“十一五”期間，我國農民專業合作社發展勢頭良好，農民專業合作社總量迅速增長，業務領域不斷拓展，日益成為增加農民收入的有效途徑，成為現代農業發展新亮點。預計到“十一五”末，全國農民專業合作社超過35萬家，實有入社農戶約2800萬，約佔全國農戶總數的10%。
    農民專業合作社廣泛分佈在種植、畜牧、農機、漁業、林業、民間傳統手工編織等各個産業，服務內容逐步向共同從事農業生産資料購買、農産品銷售、儲藏、加工等方面拓展，使農民成員更多地參與到農業生産經營多環節利潤的分享，入社農戶的收入普遍比非成員同業農戶收入高出20%以上。在産業合作的基礎上，一些農民專業合作社積極開展信用、保險等方面的互助合作。同時，農民專業合作社正在成為率先推進農業標準化生産、品牌化經營的重要力量。據統計，目前全國已有2.4萬家農民專業合作社通過了農産品“三品一標”質量認證，2.56萬家合作社擁有註冊商標。廣大農戶通過農民專業合作社，極大地推進了農業生産標準化和農産品品牌化。
    為扶持農民專業合作社加快發展，“十一五”期間，各級農業部門與各地各有關部門一道，共同著力打造五大體系，推動了合作社健康快速發展。一是推動地方立法，著力打造法律法規框架體系。2007年《農民專業合作社法》頒布實施以來，與法律相配套的《農民專業合作社登記管理條例》、《農民專業合作社示範章程》、《農民專業合作社財務會計制度（試行）》等法規相繼出臺實施，“一法一條例一章程一制度”的法律制度框架體系基本確立。各地積極出臺地方法規，促進合作社發展。截至“十一五”末，共有11個省（市）出臺地方法規。二是推動落實完善相關配套政策，著力打造政策扶持體系。據統計，“十一五”期間，有28個省（區、市）出臺了促進和支持農民專業合作社發展的專門政策文件。三是加大扶持力度，著力打造項目支持體系。中央財政累計安排合作社專項資金超過13億元。2007年到2009年，全國省級財政對農民專業合作社的扶持資金累計已達16.15億元。農業、發改、財政等7個部門聯合印發《關於支持有條件的農民專業合作社承擔國家有關涉農項目的意見》，提出適合合作社承擔的國家涉農項目，都要將合作社納入申報範圍並明確申報條件。四是強化示範引導和人才培訓，著力打造工作指導體系。啟動了示範社建設行動，以示範促規範，抓規範促發展。預計到“十一五”末，全國縣級以上示範社將達6萬家左右。人才培養提速升級。將合作社人才培養納入《國家中長期人才發展規劃綱要（2010-2020）》。“十一五”期間各類合作社人才培訓將超過100萬人次。五是開展信息宣傳和各項對接，著力打造服務體系。加強信息化建設，創辦完善“中國農民專業合作社網”，建立健全合作社信息統計系統，總結推廣安徽等省實施合作社信息化服務平臺建設經驗。廣泛開展宣傳，採取多種措施宣傳法律精神、中央政策及典型經驗，為合作社發展營造良好的發展環境和輿論氛圍。全力推進各項對接，與商務部、財政部聯手啟動“農超對接”，推動“農校對接”，探索“農企對接”新機制。據統計，通過“農超對接”將為合作社增加10-15%的收入。由農業部直接引導支持開展“農超對接”的合作社超過2000家。