黑客帝國 Ⅰ ：

　　托馬斯安德森是一個貌似普通的年輕人，但他一直用兩種方式生活著。一個身份是在一家體面的軟體公司裏做程序設計員，和所有普通人一樣過著平淡無奇的生活；而另一個身份則是電腦世界裏的著名黑客，化名是尼奧。作為一個獨自居住的人，他一直在做噩夢，就在這一天晚上，他遇到了改變他生活的事件。

　　在尼奧遇到崔尼蒂後，他的生活就開始變得詭異起來。當他上班時，他接到一個奇怪的電話，並遇到莫名其妙的追殺。

　　尼奧和特工史密斯的遭遇就像是一個噩夢一樣可怕，尼奧也願意相信這一切不過只是場噩夢。而另一個著名黑客莫菲斯的電話讓尼奧更加疑惑。為了解開這些疑團，他跟隨崔尼蒂來到了莫菲斯的房間。

　　尼奧發現自己在一個無法想象的地方醒來，隨後發生的一切都是他無法理解的。

　　當尼奧再次醒來時，他發現自己在一艘名叫“尼布甲尼撒號”的飛船上。而莫菲斯等人的形象也發生了巨大的變化，他意識到自己和周圍的世界和以前不再相同。

　　尼奧終於知道了自己的身份，他就是莫菲斯口口聲聲所説的那個“救世主”。當尼奧知道自己再也回不去後，他開始接受自己的命運。

　　在“尼布甲尼撒號”的船員中，塞弗是一個特工們有聯絡的線人。因為塞弗對真實生活感到失望，他希望回到矩陣的虛擬生活中去。因此他出賣了莫菲斯等人。

　　當莫菲斯決定帶尼奧去見先知時，塞弗終於找到了機會。他一進入矩陣，就將手機丟入垃圾桶，以便特工追蹤他們的行蹤。尼奧見到先知後，卻沒有得到答案，反而對真相更加疑惑。

　　當尼奧他們回到接頭處，因為他發現兩隻一模一樣的黑貓連續走過，大家才發現特工已經設下了埋伏。最後因為塞弗的出賣，莫菲斯為了救出尼奧，毅然犧牲自己讓尼奧逃走。

　　塞弗先回到了飛船，船上的同伴在毫無防備中被他用激光槍擊中。於是尼奧的同伴們相繼死去，正在千鈞一髮之機，重傷的坦克用激光槍擊斃了塞弗，將尼奧和崔尼蒂從矩陣中救出。尼奧為了救出莫菲斯，決定去做一件以前從來沒有人敢去嘗試過的事情。

　　特工斯密斯正在對莫菲斯嚴刑拷問，正在這時，尼奧和崔尼蒂殺入特工的總部，經過一番惡鬥救出了莫菲斯。

　　在地鐵站內，尼奧為了掩護同伴，毅然留下和特工斯密斯展開惡鬥。經過一番追逐後，尼奧還是被特工斯密斯亂槍打死。崔尼蒂和莫菲斯都不敢相信這一切。

　　尼奧再次復活，並真正開始了解矩陣的奧秘。面對可怕的特工，他不再象以前那樣逃避，而是用自己的能力就將子彈阻擋在面前，並輕易地消滅了特工斯密斯。

　　而這一切並非結尾，故事只是剛剛開始。

　　“奧西裏斯號”飛船在無意間發現成千上萬的機器烏賊正在地面集結，並用巨大的機器向地下掘進。船長達裏亞斯分析，它們的目的是毀滅位於地下的人類最後的城市——錫安。為了將這個消息送到錫安，“奧西裏斯號”飛船展開了最後的絕命飛行。船長達裏亞斯的情人喬自告奮勇進入矩陣傳送這個緊急信息，同時“奧西裏斯號”飛船為了給喬贏得送信的時間，也開始了最後的戰鬥。雖然最後“奧西裏斯號”飛船全體壯烈犧牲，但這個消息終於送達了錫安。