洪澇災害中，大量動物因災死亡，隨著氣候轉暖，動物屍體腐爛，容易造成口蹄疫、高致病性禽流感、高致病性豬藍耳病、豬鏈球菌病、鉤端螺旋體、炭疽等多種動物疫病的發生和流行。

　　根據動物疫病發生的特點，應重點做好的工作：一是及時無害化處理死亡的畜禽；二是對飼養場內外環境和屠宰場、交易市場和畜禽屍體處理等場所消毒；三是加強免疫接種；四是加強飼養管理，確保畜禽飼料和飲水安全，確保養殖環境衛生。

　　畜牧獸醫相關部門應從以下幾方面採取措施，確保大災之後無大疫。

　　一是要全力以赴，幫助災區養殖場（戶）恢復畜牧業生産，減少損失，應做好技術指導、技術幫扶、防疫知識的宣傳培訓等工作。

　　二是強化消毒，指導無害化處理。對所轄區域要加強檢查，指導、督促養殖場（戶）、養殖小區做好環境消毒和動物屍體的無害化處理。對病死畜禽不準宰殺、不準食用、不準出售、不準轉運。對不明原因死亡的畜禽要按照規定及時進行監測，如發現重大動物疫病，更要加大消毒和防控力度，並將情況及時上報。災情過後，要指導養殖場（戶）做好圈舍及周邊環境至少進行一次全面消毒。

　　三是加強疫情監測，及時報告和處置突發疫情。要進一步加強動物疫情監測工作，及時發現和排查疫情隱患，做到早發現疫情，早處置疫情，防止疫病擴散蔓延。要加強值守，堅持24小時值班和主要領導帶班制度。強化應急工作，同時根據應急預案和防治技術規範，規範處置突發疫情。要加強重大動物疫情監測工作，進一步加大受災地區動物疫情監測和流行病學調查工作力度，對病死畜禽進行採樣檢測，及時發現問題，排除疫情隱患。充分發揮動物疫情測報體系和村級動物疫情報告觀察員作用，及時匯總、分析災區動物疫情發展態勢，防止疫情發生。

　　四是加強檢疫監督，嚴防病死畜禽流出。進一步加強産地檢疫和屠宰檢疫，規範檢疫出證行為。加大對飼養、屠宰、加工、運輸、儲藏等生産和經營環節的監督管理力度，依法嚴肅處理抗拒檢疫和運輸、加工、經營未經檢疫的畜禽及其産品等行為，嚴厲打擊販賣病死動物及其産品的行為。本著有利流通、嚴格把關、打擊違法的原則，加大監督檢查力度，一方面保證進出災區的動物及其産品順暢調運，另一方面要保障動物防疫秩序，防止疫情跨區域傳播。

　　五是加強災後免疫，協助恢復畜禽生産。要根據本地前期免疫工作進度，結合受災後的實際情況和抗體監測結果，針對尚未免疫或抗體不達標的畜禽，督促開展補免和緊急免疫工作。同時，要發揮村級防疫員隊伍力量，協助有關部門做好災後畜禽生産恢復工作，做好生産技術指導，宣傳好經驗、好做法，幫助養殖場（戶）儘快恢復信心，促進畜牧生産儘快恢復，確保動物及動物産品有序供應。 要切實履行檢疫職責，嚴格執法，確保病死畜禽不出場、不出戶。嚴格對病死畜禽採取“四不準一處理”處置措施，即“不準宰殺、不準食用、不準出售、不準轉運病死畜禽及其産品”，一處理是“對死亡畜禽必須進行無害化處理”。

　　防止死亡畜禽流入市場，確保災區人民食用合格的畜禽産品，確保大災之後無大疫。

　　對於沒有進行口蹄疫、豬瘟、雞新城疫和高致病性藍耳病免疫接種的畜禽，要立即補免。對已進行了免疫接種的畜禽，根據免疫抗體檢測情況及周邊疫情情況，必要時強化免疫一次。因此，當前必須突擊抓好畜禽免疫工作。對於其他畜禽傳染病，也要根據疫情動態，做好預防接種工作。