第十六集
    老吉一行被太后宣召進宮，正趕上兩宮太后在戲樓看戲。慈安對慈禧召土郎中老吉進京頗為不解，她從骨子裏看不起這個鄉下土郎中。慈禧決定當場考考老吉。她先讓老吉對一副用九味中草藥藥名串成的長聯，老吉對得十分工整，慈禧暗中嘆服。慈禧又讓老吉為自己和慈安懸絲診脈。慈安讓七格格替她躺入賬中，老吉摸著摸著，竟虛脫暈倒。原來，老吉在診脈時發現了喜脈，他驚恐難言，只好耍了個花招。這件事引得慈安一陣嘲笑。順親王卻從中看出破綻，把老吉接到府上了解情況，老吉不敢直言，懇求順親王放他回嶺南，順親王沒有答應。

　　第十七集
    七格格陪慈禧在園中散步，慈禧想把七格格許給順親王的四貝勒，七格格卻喜歡京劇武生楊小雲。慈禧發現七格格有反胃嘔吐症狀，宣老吉進宮為七格格診脈，老吉再次被嚇個半死，原來七格格也是喜脈。賴紅姑替老吉去給七格格送藥，從七格格嘴裏得知，她那天為慈安當替身的事，老吉這才弄明白，原來懷孕的只是七格格一人。七格格懇請老吉救她，否則，就一死了之。老吉給七格格開一服打胎藥，也請七格格在太后面前説情話，放他們回嶺南。慈禧考慮到慈安對老吉的反感，決定放老吉回去，臨走前讓老吉開一些養顏美容的藥方，賴紅姑利用這個機會，寫了一張特殊的“藥方”，引發了慈禧的興趣。慈禧宣老吉、賴紅姑進見。老吉不知何故，賴紅姑卻十分坦然，當著慈禧的面對那張特殊的藥方侃侃而談，慈禧對賴紅姑十分喜歡，故而決定把老吉等人重新留下。老吉責怪賴紅姑害了他。

　　第十八集
    慈安太后突然病了，且病勢越來越重，請了幾撥太醫醫治，均不見效。慈禧宣老吉為慈安看病，老吉開出一張虎狼藥方，太醫院的人不敢依方抓藥，擅自減了藥量，結果，慈安的病非旦沒有好轉，反而危在旦夕。老吉因此被綁，就在準備行刑時，賴紅姑闖入宮中，弄清了事情真相，救了老吉。慈安因殆誤時機，已病入膏肓。老吉提出，要救慈安，必須用“鳳脂”做藥引子，所謂“鳳脂”便是西太后慈禧的血，慈禧慨然允之。慈安轉危為安，了解詳情後十分感動，當著慈禧的面，燒燬了先帝留下的秘詔。兩宮太后決定褒獎老吉救駕之功，老吉提出，既不要官，也不要錢，只求太后准許他回嶺南，兩宮太后駁回了他的請求。老吉被禦封為太醫院院長，官至五品。兩宮太后同時賜與紅姑一枚進宮腰牌，可隨時到後宮行走。

　　第十九集
    老吉半夜穿上官服起來臭美，被賴紅姑看到，奚落一番。老吉到太醫院去上班，和那些照本宣科的老夫子太醫格格不入。賀天章聽説老吉在京城當了官，千里迢迢從嶺南趕來，希望借助老吉的外力發大財。老吉在請賀天章吃飯時，偶遇李蓮英。善於投機鑽營的賀天章靠吹牛拍馬，送禮行賄等手段，討得李公公歡喜。賀天章仗著李公公的關係，盤下了專門為太醫院供藥的“濟世堂”大藥房，更名為“濟生堂”，並舉行了隆重的揭幕儀式。

　　第二十集
    老吉街上邂逅劉洪，劉洪開始説老吉認錯了人，以後又遮遮掩掩，似有難言之隱。劉洪暗示老吉當晚後海湖邊説話，老吉如期而至，劉洪已被人滅口。順親王再次安排楊小雲所有的戲班子進宮為兩宮太后唱堂會。戲演了一半，扮做戲子的殺手突然向慈禧射出毒箭，幸虧楊小雲及時用槍挑開，避免了一場血案。慈禧震怒之極，傳旨將兇手五馬分屍，賴紅姑由此看到了慈禧兇殘的一面。賴紅姑由此斷定，當年下旨殺她父親的就是慈禧。一時千仇萬恨涌上心頭，正當她準備用暗器襲擊慈禧時，被老吉制止。戲班子所有的人都因謀殺之事被打入死牢。戲班班主屈打成招，承認殺手是九門提督派來的，九門提督因此被斬首，換上了順親王的人。順親王也準備送楊小雲上西天。。老吉怕賴紅姑惹出殺身之禍，用迷藥將她麻倒。楊小雲臨刑前，被李蓮英拿著慈禧的懿旨救下，楊小雲感激慈禧救命之恩，願為慈禧收集順親王篡權謀反的證據。老吉被順親王宣進府裏看病，孔笙發現了被老吉綁起來的賴紅姑，以為老吉非禮賴紅姑，由此對師傅心生蔑視。