第一集
     2001年8月26日，遼寧省雲都市礦山公安局發生了一起重大的失槍案件，分局長袁明被停職。是夜，兩名持槍歹徒劫持了奧麗安娜娛樂城的總經理于莉，索要兩百萬。接到報警後，雲都市公安局出動大批警力包圍了奧麗安娜娛樂城，歹徒負隅頑抗，一個被擊斃一個點燃身上的炸藥身亡。省公安廳刑警總隊長黎劍臨危受命，被任命為雲都市公安局局長。此舉引起了以為能扶正的副局長霍祥的不滿。黎劍上任之後立即來到刑偵支隊和支隊長林軍一起從綁架案入手，開始了對雲都市的治安整治。

第二集
    為了感謝公安人員解救了于莉，奧麗安娜娛樂城老闆鄭翼飛設宴招待黎劍和副局長霍祥、戴文清，黎劍借機了解案情，又巧妙地通過辦公室主任方華的電話而中途離場。方華的丈夫劉浩是黎劍的戰友，在十年前的一次出警中犧牲，而案子卻一直沒破。為了讓黎劍儘快地了解雲都的情況，方華帶著黎劍來到汪老漢家。汪老漢的兒子汪小明也是十年前被害的，案子不了了之，汪老漢的兒媳也瘋了，汪老漢連年上訪卻無結果。看著可憐的汪老漢一家，黎劍眼中涌出淚水。

第三集
    刑偵支隊長林軍給了黎劍一份自己私下準備的近幾年雲都市發生的大案要案備忘。黎劍發現以馬福貴為首的黑惡勢力已經無惡不作，他來到霍祥家向霍祥了解情況，霍祥卻告訴他雲都有特殊的地方，不能完全按照原則辦事，兩人不歡而散。黎劍來到沙河街派出所檢查，卻發現所長江楓值班睡大覺，報警電話無人接聽，黎劍將江楓當場停職。疲憊的黎劍夜裏回到省城的家中，向妻子徐蕾敘述衷腸。

第四集
    黎劍和林軍看望被黑惡勢力迫害的某酒店胡經理，又來到礦區向袁明等了解826失槍案的情況。同時得知袁明等礦區的警察生活很困難，常常發不出工資。霍祥卻對黎劍一上任就往一線跑而不和和局黨委幾個領導溝通，把他們這些人晾在一邊頗有微詞。鄭翼飛的手下彭俊對馬福貴常常來尋事不滿，也不理解鄭翼飛為什麼總讓著馬福貴，鄭翼飛卻冷笑著告訴彭俊馬福貴猖狂不了多長時間了。黎劍來找市政法委書記程志，向他彙報在雲都了解的情況，二人取得共識，要在雲都搞一次大規模的整治行動，要堅決打擊黑惡勢力的囂張氣焰。並把這次行動定為“雲劍行動”。

第五集
    馬福貴通過江楓要請林軍和黎劍吃飯，結果迎來的卻是林軍帶著刑警對他的洗浴中心的清查。馬福貴恨得直咬牙，恰在此時他患有白血病的兒子小順子又發高燒，馬福貴明白自己遇到對手了。 “雲劍行動”狠狠地打擊了黑惡勢力，收到顯著成效，然而對於如何處置犯罪分子，黎劍和霍祥有了分歧，霍祥希望多罰款以增加辦案經費，黎劍卻認為要以此為突破口，偵破大案和要案。馬福貴的手下李柱子被抓後，經技術鑒定他的指紋和826失槍現場的一個指紋一致，黎劍連夜和林軍來到看守所準備提審李柱子，然而李柱子卻被人提前一步毒死在看守所。