茶水博士和小金剛在飛機上遇到了磁氣風暴，飛機眼看就要遇難，多虧小金剛及時幫忙才使得飛機平安落到海面。但是小金剛卻突然失去了意識掉入深海並撿到了一塊太空水晶。茶水博士為小金剛製造了機器人爸爸媽媽和他一起生活，小金剛很是感動開心。警察在追捕逃犯思坎克的時候，卻被一個騎著機器馬的人所救，原來是亞特拉斯，他復活了。思坎克唆使亞特拉斯搶劫了銀行和珠寶店等，引起人民恐慌。亞特拉斯搶走了小金剛的父母親，小金剛憑著和亞特拉斯的心靈呼應找到了他，經過他的努力，他戰勝了變得邪惡的亞特拉斯並損壞了他的機器人基地，救回了自己的父母。